OTÁZKY KE ZKOUŠCE Z LÉKAŘSKÉ CHEMIE A BIOCHEMIE 2003/2004

I. ZÁKLADY FYZIKÁLNÍ, BIOANORGANICKÉ A BIOORGANICKÉ CHEMIE

1.	Voda a její fyzikální a chemické vlastnosti, význam v organismu
2.	Rozpustnost látek v polárních a nepolárních rozpouštědlech, příklady z biochemie
3.	Pravé a koloidní roztoky, difuse, osmosa, dialysa, příklady z biochemie
4.	Chromatografie a elektroforesa, příklady využití v  biochemii
5.	Energetika chemických reakcí, Gibbsova energie a entropie, aplikace na metabolické děje.
6.	Kinetika a energetika následných a vratných reakcí, chemická rovnováha, Guldbergův – Waageův zákon
7.	Reakční kinetika a její aplikace v enzymologii
8.	Katalyzátory a biokatalyzátory, význam v biochemických dějích
9.	Elektrolytická disociace, disociační konstanta, silné a slabé elektrolyty, příklady z biochemie
10.	Brönstedova teorie kyselin a zásad, rovnováha v protolytických reakcích, příklady z biochemie
11.	Iontový součin vody, pH a jeho význam v medicině
12.	Amfolyty, jejich vlastnosti, příklady z biochemie
13.	Pufry, výpočet pH, význam v organismu
14.	Oxidace a redukce, příklady z biochemie
15.	Oxidoredukční potenciál, závislost na koncentraci reaktantů a na pH, příklady z biochemie
16.	Srážecí reakce, součin rozpustnosti, příklady z biochemie
17.	Tvorba komplexů, význam v biochemii a medicině
18.	Uhlík a jeho anorganické sloučeniny významné pro biochemii
19.	Kyslík, jeho anorganické sloučeniny a reaktivní formy význam
20.	Vodík, příklady uplatnění v metabolismu
21.	Dusík a jeho biologicky důležité anorganické sloučeniny
22.	Síra, fosfor a jejich biologicky a toxikologicky významné sloučeniny
23.	Biologicky a toxikologicky významné prvky hlavních skupin periodického systému mimo základních biogenních prvků
24.	Biologicky a toxikologicky významné prvky vedlejších skupin periodického systému 
25.	Chemické znečistění životního prostředí
26.	Struktura organických sloučenin, izomerie, příklady z metabolických drah
27.	Závislost vlastností organických sloučenin na jejich struktuře, příklady z biochemie
28.	Halogen- a nitroderiváty uhlovodíků, příklady toxikologicky a lékařsky významných sloučenin
29.	Sirné deriváty uhlovodíků, příklady lékařsky významných sloučenin
30.	Aminy, význam v biochemii
31.	Alkoholy, fenoly, aldehydy a ketony, uplatnění v metabolismu
32.	Karboxylové kyseliny, uplatnění v metabolismu
33.	Estery karboxylových a anorganických kyselin, uplatnění v biochemii
34.	Funkční a substituční deriváty karboxylových kyselin, uplatnění v biochemii
35.	Kyslíkaté a sirné heterocykly, význam
36.	Dusíkaté heterocykly, význam
37.	Terpeny a alkaloidy, příklady a význam
38.	Biopolymery, význam
39.	Kódované aminokyseliny
40.	Peptidy, peptidová vazba, příklady biologicky významných peptidů
41.	Bílkoviny, struktura, vlastnosti a funkce
42.	Konformace bílkovin, význam pro biologickou funkci bílkovin
43.	Holoproteiny, heteroproteiny a metaloproteiny, příklady
44.	Sacharidy, rozdělení, struktura, stereochemie, biologický význam
45.	Reakce a deriváty monosacharidů
46.	Glykosidy, příklady
47.	Disacharidy, homopolysacharidy a heteropolysacharidy, příklady
48.	Proteoglykany, glykoproteiny, struktura, vlastnosti, příklady
49.	Lipidy, definice, klasifikace, struktura, vlastnosti, funkce v organismu
50.	Steroly, struktura, klasifikace, vlastnosti a funkce v organismu

II. ZÁKLADY METABOLISMU

1.	Struktura enzymů (kofaktory, koenzymy, oligomerní struktura)
2.	Mnohočetné enzymové formy a isoenzymy
3.	Enzymová aktivita, fyzikálně chemické vlivy, regulace (exprese, allosterické vlivy, kovalentní modifikace)
4.	Využití enzymologie v medicině
5.	Dýchací řetězec
6.	Oxidativní fosforylace, fosforylace na substrátové úrovni
7.	Makroergní sloučeniny, pohon endergonních reakcí
8.	Citrátový cyklus, amfibolický charakter, průběh, regulace
9.	Struktura a funkce membrán, membránový transport
10.	Obecné mechanismy přeměny aminokyselin, dusíková bilance
11.	Mechanismus transaminace, stanovení aktivity aminotransferas
12.	Deaminace aminokyselin
13.	Tvorba amoniaku, jeho detoxikace, ureosyntetický cyklus a jeho regulace, hyperamonémie
14.	Metabolismus uhlíkového skeletu aminokyselin, zapojení aminokyselin do metabolických procesů
15.	Aminokyseliny skupiny pyruvátu, oxalacetátu a 2-oxoglutarátu, jejich katabolismus
16.	Aminokyseliny skupiny sukcinyl CoA a jejich katabolismus
17.	Metabolismus aminokyselin s rozvětveným řetězcem
18.	Metabolismus fenylalaninu a tyrosinu, poruchy
19.	Metabolismus tryptofanu, hlavní a vedlejší dráhy, poruchy resorpce
20.	Metabolismus sirných aminokyselin
21.	Biosyntéza, biodegradace a funkce katecholaminů
22.	Konverze aminokyselin do specializovaných produktů (kreatin, jeho přeměny a význam, S-adenosylmethionin a jeho význam)
23.	Biosyntéza a biodegradace nejdůležitějších biogenních aminů 
24.	Glykolysa, regulace
25.	Glukoneogenese, regulace
26.	Degradace a syntesa glykogenu, regulace, poruchy
27.	Pentosový cyklus, regulace
28.	Metabolismus galaktosy a fruktosy, poruchy
29.	Metabolismus kyseliny glukuronové a její význam v organismu
30.	Nasycené mastné kyseliny, jejich syntéza "de novo", regulace
31.	Zdroje acetylCoA pro syntézu palmitátu, využití palmitátu pro syntézu nenasycených mastných kyselin a mastných kyselin s dlouhým řetězcem
32.	Tvorba ketolátek z acetyl-CoA, metabolické příčiny, význam
33.	Karnitinový systém, oxidace mastných kyselin, energetický výtěžek
34.	Triacylglyceroly, biosyntéza, přeměna a transport
35.	Kyselina fosfatidová, fosfolipidy, struktura, metabolismus, funkce
36.	Biosyntéza sfingosinu, sfingolipidy, struktura, vlastnosti a funkce v organismu
37.	Syntéza a degradace eikosanoidů, cyklooxygenasová a lipoxygenasová cesta
38.	Biosyntéza cholesterolu a její regulace, úloha HMG-CoA reduktasy
39.	Transport endogenního a exogenního cholesterolu
40.	Přeměna a vylučování cholesterolu, žlučové kyseliny
41.	Biosyntéza, degradace a funkce steroidních hormonů
42.	Transport lipidů, úlohy lipoproteinů, struktura lipoproteinové částice
43.	Vznik, přeměna a úloha chylomiker a VLDL lipoproteinů
44.	Vznik, přeměna a úloha LDL a HDL lipoproteinů
45.	Biosyntéza tetrapyrrolů – hemu, poruchy syntézy, porfyrie
46.	Degradace tetrapyrrolů, hyperbilirubinemie, iktery
47.	Pyrimidinové nukleotidy, metabolismus, regulace, poruchy, inhibitory a jejich využití
48.	Purinové nukleotidy, metabolismus, regulace, poruchy, inhibitory a jejich využití, hyperurikémie
49.	„Záchranná“ biosyntéza nukleotidů a regulace metabolismu purinových nukleotidů, resorpce N-bazí, nukleosidů a nukleotidů
50.	Biosyntéza deoxyribonukleotidů a její regulace, inhibitory

III. ZÁKLADY BIOCHEMIE ORGÁNŮ A FUNKCÍ

1.	Regulace a koordinace metabolismu sacharidů a lipidů
2.	Trávení a resorbce sacharidů
3.	Glykemie, regulace, diagnostika (oGTT, glykovaný hemoglobin)
4.	Hormonální řízení metabolismu glukosy a glykogenu
5.	Vztah metabolismu glukosy a ostatních živin
6.	Coriho cyklus
7.	Utilisace ketolátek v extrahepatálních tkáních
8.	Lipolýza, úloha, mechanismy, regulace, význam
9.	Metabolismus tukové tkáně
10.	Regulace biosyntézy hemu, rozdíly mezi hepatocytem a erythroidní buňkou, metabolismus železa
11.	Resorpce a transport aminokyselin
12.	Regulace metabolismu na neurohumorální úrovni – „integrující systémy organismu“
13.	Hormonální regulace vodního a minerálního metabolismu
14.	Hormonální regulace kostního metabolismu
15.	Hormonální regulace energetického metabolismu
16.	Biochemické pochody v žaludku, sekrece žaludeční šťávy a její regulace, vlastnosti a funkce žaludečních mucinů, acidorezistentní lipasy
17.	Biochemické pochody při trávení živin v tenkém a tlustém střevu, úloha pankreatu při trávení živin
18.	Biochemické funkce hepatocytů a jater, možnosti biochemické diagnostiky poškození hepatocytů a jaterních funkcí
19.	Biotransformace endogenních a exogenních látek, typy biotransformačních procesů, toxické a kancerogenní látky v životním prostředí
20.	Ústojné systémy organismu
21.	Hydrogenuhličitanový systém, jeho funkce a význam pro acidobazickou rovnováhu
22.	Úloha hemoglobinu, proteinů a fosfátů v procesu udržování ABR
23.	Kompenzační mechanismy ABR
24.	Krev, složení, význam, funkce
25.	Metabolismus erythrocytů
26.	Hemokoagulace
27.	Biochemické základy činnosti ledvin, tvorba moče
28.	Osud kolagenu (syntéza až degradace)
29.	Adhesivní glykoproteiny pojiva
30.	Biochemie chrupavky a kostí
31.	Biochemie kůže
32.	Kontraktilní aparát, řízení kontrakce hladké a kosterní svaloviny
33.	Biochemie vidění, Waldův cyklus
34.	Biochemie nervových synapsí
35.	Receptory, struktura a funkce
36.	Neurotransmitery, rozdělení, funkce
37.	Steroidní hormony a jejich funkce v regulačních dějích
38.	Peptidové hormony a jejich funkce v regulačních dějích
39.	Hormony štítné žlázy a jejich funkce v regulačních dějích
40.	Prostaglandiny, prostacykliny, tromboxany, leukotrieny, hydroxyepoxytrienové kyseliny
41.	Imunoglobuliny, klasifikace, struktura
42.	Imunogeny a antigeny, molekulární základy humorální a buněčné imunitní odpovědi
43.	Teorie tvorby protilátek, reakce antigenu a protilátek, metody detekce
44.	Biochemie výživy, esenciální mastné kyseliny a aminokyseliny
45.	Biochemie výživy, vitamíny a význam stopových prvků
46.	Vitamíny rozpustné v tucích
47.	Vitamíny rozpustné ve vodě
48.	Struktura buněčných membrán, fluidita membrán, vazby bílkovin na lipidy membrán 
49.	Transport látek přes membrány, pasivní a aktivní transport, endocytosa
50.	Transport látek přes membrány, iontové kanály

IV. Základy buněčné a molekulární biologie

1.	Signální transdukce, membránové receptory a jejich ligandy, G-proteiny
2.	Signalizace přes proteiny ras, kaskády kinas
3.	Aktivace fosfolipas v signální transdukci
4.	Signalizace NO. Přehled signálních cest a význam
5.	Signální transdukce, intracelulární receptory a jejich ligandy, HSP, interakce intracelulárních receptorů s DNA
6.	Mezibuněčná komunikace
7.	Organizace prokaryontního, eukaryontního a mitochondriálního genomu
8.	Replikace eukaryontní DNA, replikační aparát a jeho regulace
9.	Reparace DNA
10.	Transkripce eukaryontní genomové DNA, transkripční aparát a jeho regulace, cis- a trans-regulační elementy
11.	mRNA, struktura, syntéza, posttranskripční úpravy a úloha při translaci
12.	Regulace genové exprese na úrovni transkripce
13.	Genetický kód a jeho vlastnosti
14.	Signály pro zahájení a ukončení eukaryontní a prokaryontní translace
15.	Struktura a funkce nukleových kyselin
16.	Úloha tRNA v translaci, aktivace aminokyselin, úloha aminoacyl-tRNA synthetas
17.	Struktura bakteriálních a eukaryontních ribosomů, volné a memránové ribosomy, polyribosomy a jejich úloha v translaci
18.	Fáze eukaryontní a prokaryontní translace (iniciace, elongace, terminace)
19.	Rozdíly eukaryontní, prokaryontní a mitochondriální translace
20.	Regulace genové exprese na úrovni translace, inhibitory translace, antibiotika působící na translaci
21.	Posttranslační úpravy proteinů 
22.	Třídění a transport proteinů, úpravy a třídění proteinů v Golgiho aparátu
23.	Biosyntéza glykoproteinů, jejich struktura a význam
24.	Elektroforetická analýza nukleových kyselin a proteinů, přenos na membrány, blottingy, význam
25.	Restrikční enzymy a jejich využití, úpravy DNA a konstrukce rekombinantních molekul DNA
26.	Mapování genomu
27.	Klonování DNA v plazmidových vektorech, konstrukce genomové knihovny v λ vektorech a její screening, expresní vektory 
28.	Hybridizační sondy a jejich značení
29.	Možnosti DNA diagnostiky
30.	Techniky přímé DNA diagnostiky
31.	Nepřímá DNA diagnostika, polymorfismus délky restrikčních fragmentů 
32.	Přenos cizí genetické informace do bakterií a savčích buněk
33.	Možnosti genové terapie, přenos genetického materiálu při genové terapii
34.	Nejdůležitější hybridizační techniky a jejich uplatnění v klinické diagnostice
35.	Imunoblotting a imunoprecipitace
36.	Metody frakcionace buňky
37.	Techniky sekvenování DNA
38.	Polymerasová řetězová reakce, uplatnění PCR v klinické diagnostice
39.	Amplifikace molekul RNA pomocí RT-PCR a využití této techniky
40.	Geneticky podmíněná onemocnění a jejich diagnostika
41.	Dědičná dispozice k nádorovému onemocnění a její diagnostika
42.	Povaha lidských genových mutací
43.	Mutace dědičné a získané, polymorfismy, jejich význam a detekce
44.	Minisatelitové a mikrosatelitové markery a jejich analýza, DNA fingerprinting
45.	Retroviry a pararetroviry, struktura a replikace
46.	Úloha protoonkogenů a tumor supresorových genů
47.	Buněčný cyklus, přehled komplexů cyklinů a cdks
48.	Regulace buněčného cyklu, úloha tumor supresorových genů
49.	Apoptóza – iniciační, kontrolní a efektorová fáze, význam death receptorů a jejich ligandů, kaspasy
50.	Apoptóza – intrinzická a extrinzická cesta aktivace, úloha mitochondrie