na začátek5-HIAA - 5-hydroxyindoloctová kyselina
5-HT - 5-hydroxytryptamin, serotonin
AC - adenylátcyklasa (též adenylylcyklasa)
ACTH - adrenokortikotropní hormon
AR - adrenergní receptory, adrenoreceptory, adrenoceptory
BDNF - mozkový neurotrofní faktor (brain-derived neurotrophic factor)
CAA - suma aminokyselin soutěžících s L-TRP o tentýž transportní mechanismus
CaM - kalmodulin
cAMP - cyklický adenosinmonofosfát
cGMP - cyklický guanosinmonofosfát
CNS - centrální nervový systém
COMT - katechol-O-metyltransferasa
CREB - protein vázající se v genomu na element odezvy na cAMP („cAMP response element-binding protein“)
CRF - uvolňovací faktor pro kortikotropin (též uvolňovací hormon pro kortikotropin, CRH)
CSF - mozkomíšní mok
DA - dopamin
DG - sn-1,2-diacylglycerol (obvykle 1-stearoyl-2-arachidonoyl-sn-glycerol)
DST - dexametasonový supresní test
ECT - elektrokonvulsivní terapie
FFA - volné mastné kyseliny
G protein - protein vázající guaninové nukleotidy (GTP, GDP)
Ga - a podjednotka G proteinu
Gs,i,o,q,11 - skupiny G proteinů
GABA - 4-aminomáselná kyselina (též g-aminomáselná kyselina)
GTP - guanosin-5´-trifosfát
GDP - guanosin-5´-difosfát
HPA - hypotalamus-hypofýza-kůra nadledvin
HVA - homovanilová kyselina
IL - interleukin
IP3 - inositol-1,4,5-trisfosfát
LC - locus coeruleus
L-TRP - L-tryptofan
MAO-A - monoaminoxidasa typu A
MAOI - inhibitor MAO
MAP - mitogeny aktivované kinasy
MHPG - 3-metoxy-4-hydroxyfenylglykol
mRNA - messenger RNA
NA - noradrenalin (též norepinefrin)
NMDA - N-metyl-D-aspartát
PI - fosfatidylinositol
PIP - fosfatidylinositol fosfát
PIP2 - fosfatidylinositol-4,5-bisfosfát
PK - proteinkinasa
PKA - proteinkinasa typu A
PKC - proteinkinasa typu C
PKCaM - proteinkinasa závislá na vápníku a kalmodulinu
PL - fosfolipasa
PLA2 - fosfolipasa typu A2
PLC - fosfolipasa typu C (též polyfosfoinositidasa C)
PLD - fosfolipasa typu D
PP - fosfoproteinfosfatasa
Raf - typ proteinkinasy
Ras - G protein o malé molekulové hmotnosti
RIMA - reversibilní selektivní inhibitor MAO-A
SNRI - inhibitor reuptake serotoninu a noradrenalinu
SRI - inhibitor reuptake serotoninu
SSRI - selektivní SRI
TCA - tricyklická antidepresiva