Rules

Only in Czech so far

Úvod

S ohledem na zásadní proměnu mikroskopické laboratoře spočívající především v akvizici nového konfokálního systému je nutné zpřesnit doposud platné provozní "gentlemanské" dohody. Cílem je, zajistit co nejširší prostupnost systému, zefektivnít využití mikroskopu a zajistit provozuschopnost celého systému pro následující období. Mikroskopický systém této kategorie má mnoho technických aspektu, které nemusí být na první uživatelský pohled jasně zřejmé. Následující pravidla jsou tedy koncipována především s ohledem na prevenci nežádoucích událostí vyžadující servisní zásah (poškození komponent systému), a v druhé řadě na udržení systému v bezvadném stavu bez přítomnosti jevů zhoršujících kvalitu získaných dat (zašpinění objektivů, nekvalifikovaná změna nastavení apod.). Preferovým způsobem práce uživatelů je samostatné úžívání bez zásahu supervizora. Toto je možné pouze po úvodním zaškolení pro používané komponenty systému, sestávající jak z teoretické znalosti funkce těchto komponent tak jejich praktické aplikace.

Samoobslužná znalost užívání standardního setupu TE2000 s C1si zahrnuje

• znalost zapínání a vypínání všech komponent systému
• spolehlivé ovládání motorizovaných komponent TE2000
• použití a porozumení sestavám epifluorescencních BP bloku, BP filtru v PMT detector boxu, sestave primárních dichroických zrcadel a beam splitteru ve skenovací hlave
• správné použití laseru včetně nastavování jejich výkonu
• správné použití objektivu se zvláštním důrazem na prevenci jejich poškození
• správná korekce sampling density obrazu dle Nyquista, odhalení a korekce a spektrálního cross-talk
• znalost a pochopení použití variabilní velikosti pinhole a pixel-dwell time laseru
• znalost práce se základními mody C1si (average, channel series, Z-stack, time series)
• ovládání kamery DS-U2/3 a práce sft NIS-elements
• základní úroven znalosti práce se spektrální modalitou C1si není v tuto chvíli jednoduché definovat, proto je vždy vhodné pracovat s asistencí technika ci správce

Zmínené body by "měly" zajistit uživateli přehled o jeho vlastní samoobslužnosti a do jisté míry garantovat uživatelskou gramotnost chránící systém před zbytečným poškozením. Nemůžeme, než predpokládat dostatečcnou míru sebekontroly ze strany uživatelů s ohledem na jejich vlastní data a systém jako celek.

Správce

• provádí školení uživatelů pro samostatnou obsluhu komponent
• zajištuje pokud možno plynulý chod systému
• manipuluje s mikroskopem v celém jeho hardwareovém i softwareovém rozsahu
• vytvárí uživatelské profily TE2000 a EZ C1si
• spravuje obecne dostupnou databázi PSF
• poskytuje hlubší technické informace o systému
• konzultuje experimentální design vcetne analýzy dat (při zájmu uživatele)

Uživatel

• JE ZODPOVĚDNÝ ZA VLASTNÍ DATA
• používá přidělený úcet (login a heslo), nepracuje na systému bez zápisu do časového rozvrhu (byť zpětného)
• k rezervaci pracovního casu využívá výhradne www rozhraní
• presuny rezervovaného casu reší uživatelé mezi sebou, nikoliv prostrednictvím správce
• respektuje rozsahem vlastních rezervací ostatní uživatele, ve vyjímecných prípadech jsou správcem provádeny zmeny a presuny rezervací pouze po dohode s uživatelem
• nemanipuluje s hardwarovou sestavou mikroskopu bez předchozí dohody a instruktáže správcem ci jinou správcem explicitně autorizovanou osobou
• uživatelé nemění jiné než vlastní softwarové a hardwareové profily
• uživatelé spravují dle vlastního uvážení přidelený uživatelský diskový prostor na všech počítačích mikroskopického centra (obsah diskového prostoru není průběžne zálohován)
• na výzvu správce odstraňují v uvedeném termínu data z diskového prostoru
• respektují přenos dat směrem z počítace nikoliv opačne
• respektují doporučení správce
• základní zaškolení nove registrovaného uživatele provádí pouze správce mikroskopu (prípadne jím urcená osoba), další sdílení zkušeností s obsluhou mezi uživateli je vítané
• VEŠKERÉ PROBLÉMY FUNKCE SYSTÉMU (VČETNE SOFTWAROVÝCH) SDĚLUJÍ OKAMŽITE SPRÁVCI

POZOR KONTROVERZNÍ!!

Mikroskopie a image analysis predstavují komplexní oblast, kterou není zcela jednoduché, byť v omezené míře, obsáhnout. Mikroskopii na ÚDMP lze považovat za "micro core facility" zajišťující servis v celém rozsahu včetně experimentálního designu, vyhodnocování a interpretace dat, pokud bude vyžadován. Problém intelektuální kontribuce a spoluautorství byl mnohokrát řešen a existují obecně přijaté normy spoluautorství a technické pomoci (viz. http://pareonline.net/getvn.asp?v=5&n=1). Chtěl bych proto všechny uživatele požádat o citlivé zvážení této otázky. Téma to není jednoduché, jelikož jej nemají uspokojive vyrešeno ani daleko vetší "core-facility based" instituce kalibru Max-Planck ústavu (osobní komunikace).

Rád bych předeslal, že tahle poznámka by neměla být chápána jako požadavek spoluautorství na základe pořízení obrázku. Za minimální, resp. výchozí nutno považovat "worth acknowledging" o použití přístroje a publikace obsahující takovou referenci deponovat u správce mikroskopu.

Zpracoval: Jakub Sikora (03/2006) Robert Dobrovolný (11/2014)